根据国家、重庆市、学校的相关管理文件精神，中心结合自身的实际，遵循制度规范化、管理人性化的原则，制定了健全的管理规章制度，保障中心的建设发展更加科学、规范和有序，主要包括《工程技术研究中心建设与管理办法》、《主任工作条例》、《学术委员会工作规范》、《人员聘任管理与绩效考核办法》、《科研工作管理及奖励条例》、《开放基金项目管理办法》、《实验设备管理与开放共享办法》、《安全管理条例》等规章制度。